Le tubercule de semence est une source importante d’inoculum pour la contamination des tubercules fils de pomme de terre par les Erwinia pectinolytiques. Cependant, les processus et la cinétique de contamination des différents organes de la plante, y compris les tubercules fils, sont méconnus, faute d’une détection efficace de la bactérie au sein de la plante tout au long de la culture. Les objectifs de ce travail étaient donc de mettre au point des outils de détection fiables, sensibles, rapides et spécifiques d’Erwinia carotovora subsp. atroseptica (Eca), sous espèce la plus préjudiciable sous les climats tempérés, et de les appliquer à l’étude de la transmission de la bactérie du tubercule mère vers les tubercules fils en cours de culture.

Les améliorations apportées aux techniques de détection par PCR (validation d’amorces spécifiques d’Eca et d’un système de révélation colorimétrique sur microplaques) ou par sérologie (DAS ELISA avec une étape d’enrichissement) ont permis de conférer à ces techniques les qualités requises pour leur application à un suivi épidémiologique. Cependant, les résultats obtenus ont montré une meilleure performance de l’ELISA par rapport à la PCR sur des échantillons naturellement contaminés.

Le suivi de la colonisation des différents organes au champ a montré que les organes sains issus de plantes asymptomatiques sont moins contaminés que ceux provenant de plantes symptomatiques. Les stolons sont précocement et plus fréquemment contaminés que les tiges et tubercules fils, indépendamment de l’état de la plante et du cultivar dont ils sont issus. Les bactéries sont retrouvées 10 à 15 cm au delà des lésions visibles sur les tiges des deux cultivars testés, mais la contamination des tiges est plus fréquente chez Bintje que chez Désirée. Les tubercules fils asymptomatiques testés à la récolte sont fortement contaminés, indépendamment du cultivar. Les contaminations se situent principalement au point d’attache des stolons, suggérant un processus de contamination interne du tubercule mère vers les tubercules fils.

Cependant, les taux de contaminations latentes similaires des tubercules des deux cultivars à la récolte ne se traduisent pas par un comportement identique en végétation, Bintje exprimant plus de symptômes que Désirée. De même, la descendance de Bintje présente plus fréquemment des symptômes visibles que celle de Désirée. Les pertes de rendement, variant selon les types de symptômes et les dates de notation, justifient la distinction des différentes manifestations symptomatologiques de la maladie. Nos données suggèrent que les estimations d’impact des symptômes sur le rendement les plus adéquates sont celles faites aux alentours du début de la tubérisation. Le rendement plus faible des plantes asymptomatiques issus de tubercules inoculés comparé à celui des plantes témoins indique que la présence de la bactérie au niveau du tubercule de semence nuit au rendement, même en l’absence de symptômes visibles, ceci d’autant plus que le cultivar est sensible.

Le travail mené a conduit à une amélioration des connaissances sur les populations d’Erwinia, à une évaluation et mise au point d’outils de détection et à une étude épidémiologique permettant d’obtenir des précisions sur la colonisation des plantes en végétation et sur la transmission d’Eca du tubercule mère aux tubercules fils. Il devra se poursuivre par une validation lors d’une deuxième année d’expérimentation des données obtenues, et par la mise au point de méthodes de détection quantitative permettant d’apprécier les seuils de contamination minimaux nécessaires au développement de la maladie selon le cultivar.